措钦大殿位于哲蚌寺的核心，占地4500多平方米，经堂内有190多根柱子，可容纳七千到一万名喇嘛，是全寺僧人集中诵经和举行典礼的场所。沿廊前石阶而下是开阔的辩经场，各扎仓的喇嘛要在此立宗答辩，获胜前方能参与传昭大法会的格西资历考试。供奉的主佛是大白伞盖佛母像和无量胜佛9岁身量像。后殿正中供有一尊二层楼高的鎏金“弥旺强巴佛”；左边配殿是三世佛殿，供有过去佛燃灯、如今佛释迦牟尼、将来佛强巴三尊佛像；右边配殿内供着各种佛经。佛殿回廊的出口处有一方清朝同治皇帝的御笔匾额，上书“输成向化”。大殿西侧的“龙崩康”是灵塔殿，其中三座银塔格外引人瞩目，中间一座即二世达赖喇嘛的灵塔，左右两塔为哲蚌寺的祖师塔。大殿三楼的祖师殿有藏经阁和强巴通真佛殿，供奉着强巴佛8岁铜像，铜像上的法螺据传是释迦牟尼的遗物，为镇寺法宝。四楼主殿供有释迦牟尼说法像，两旁还有13座银塔。侧殿为罗汉堂，内供佛教历代祖师和罗汉等神像，并供有哲蚌寺主要大活佛的报身像。